上海科学技术大学全宗由文书档案、教学档案、科研档案和设备、基建、声像等档案组成。

（1）文书档案主要有党群、行政、外事、教务四大类。党群类党务综合主要有中央、市委文件，学校党代会的会议文件，党委会会议记录，工作计划，报告，总结，决议，活动安排，党委工作简报，党总支会议记录，情况汇报等文件；纪委主要有纪检工作规章制度，纪委工作计划，总结，调查报告，处分材料，人民来信等；组织主要有机构设置，组织工作计划，总结，决定，批复，通知，干部任免，入党退党，转正材料，党校学习计划，活动安排等；宣传主要有学校宣传工作计划，决定，通知，总结，思想动态和反映，宣传材料等；统战主要有统战工作计划，民主党派活动材料；工会主要有工代会材料，人民代表名单，会员名册，先进集体、个人材料，休养材料；团委主要有团代会、学代会材料，工作计划，报告，总结，表彰、处分材料，入团、离团材料等。

行政综合类主要有国家教委，上海市教委、高教局有关学校的综合文件，规章制度，工作计划，总结，报告，通知，批复，启用印章的文件，学校沿革，简介，大事记等；人事主要有学校人事工作计划，总结，定编，批复，教职工奖惩材料，师资培养，人事报表，职称评定，工资管理，职工调动材料；总务主要有总务工作计划，工资计划，报告，总结，房产管理等；教务主要有教学培训计划，教学计划，规章制度，统计报表，重点学科、实验室建设，学籍管理，招生、毕业材料等；外事主要有外事工作文件，学校外事工作计划，总结，出国考察、访问讲学材料，外籍人员来校，国际会议，留学生材料等。

（2）教学档案主要是历届学生成绩大表、研究生学位论文及评审材料。

（3）科研档案主要有科研行政计划，科研成果，科研经费管理文件，科研准备阶段的计划任务书、申请书、合同、协议书，实验阶段形成的各类原始记录、数据处理材料、设计的文字说明和图纸，总结草稿，鉴定证书，申报成果阶段的科研成果登记表、科研成果申报表、科研成果奖励和审批材料，科研成果获奖证书（复印件），推广阶段的使用报告、技术转让合同、协议材料等。

（4）其它档案主要有设备、基建、声像等档案。其中设备档案主要有学校购置大型仪器设备的合同、开箱验收报告、仪器说明书等资料；基建档案主要有学校各类用房平面图，水、电管道的走线图等；声像档案主要反映学校行政管理、教学研究、外事、文体活动方面活动的照片。